Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FRMD3A2A2Y4 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FRMD3A2A2Y4 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FRMD3A2A2Y4 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FRMD3A2A2Y4 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FRMD3A2A2Y4 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FRMD3A2A2Y4 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
FRMD3A2A2Y4 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FRMD3A2A2Y4 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FRMD3A2A2Y4 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FRMD3A2A2Y4 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FRMD3A2A2Y4 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FRMD3A2A2Y4 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FRMD3A2A2Y4 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FRMD3A2A2Y4 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FRMD3A2A2Y4 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FRMD3A2A2Y4 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FRMD3A2A2Y4 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FRMD3A2A2Y4 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FRMD3A2A2Y4 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FRMD3A2A2Y4 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FRMD3A2A2Y4 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FRMD3A2A2Y4 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FRMD3A2A2Y4 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FRMD3A2A2Y4 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FRMD3A2A2Y4 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FRMD3A2A2Y4 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FRMD3A2A2Y4 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
FRMD3A2A2Y4 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FRMD3A2A2Y4 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FRMD3A2A2Y4 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FRMD3A2A2Y4 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FRMD3A2A2Y4 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FRMD3A2A2Y4 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FRMD3A2A2Y4 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FRMD3A2A2Y4 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FRMD3A2A2Y4 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FRMD3A2A2Y4 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
FRMD3A2A2Y4 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FRMD3A2A2Y4 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FRMD3A2A2Y4 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FRMD3A2A2Y4 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FRMD3A2A2Y4 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FRMD3A2A2Y4 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FRMD3A2A2Y4 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FRMD3A2A2Y4 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FRMD3A2A2Y4 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FRMD3A2A2Y4 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FRMD3A2A2Y4 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FRMD3A2A2Y4 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FRMD3A2A2Y4 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FRMD3A2A2Y4 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FRMD3A2A2Y4 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FRMD3A2A2Y4 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FRMD3A2A2Y4 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FRMD3A2A2Y4 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FRMD3A2A2Y4 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FRMD3A2A2Y4 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FRMD3A2A2Y4 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FRMD3A2A2Y4 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FRMD3A2A2Y4 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FRMD3A2A2Y4 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FRMD3A2A2Y4 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
FRMD3A2A2Y4 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
FRMD3A2A2Y4 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
FRMD3A2A2Y4 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
FRMD3A2A2Y4 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FRMD3A2A2Y4 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FRMD3A2A2Y4 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FRMD3A2A2Y4 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FRMD3A2A2Y4 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FRMD3A2A2Y4 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FRMD3A2A2Y4 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FRMD3A2A2Y4 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FRMD3A2A2Y4 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FRMD3A2A2Y4 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FRMD3A2A2Y4 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FRMD3A2A2Y4 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FRMD3A2A2Y4 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FRMD3A2A2Y4 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FRMD3A2A2Y4 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FRMD3A2A2Y4 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FRMD3A2A2Y4 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FRMD3A2A2Y4 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FRMD3A2A2Y4 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FRMD3A2A2Y4 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FRMD3A2A2Y4 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FRMD3A2A2Y4 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FRMD3A2A2Y4 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FRMD3A2A2Y4 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FRMD3A2A2Y4 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FRMD3A2A2Y4 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FRMD3A2A2Y4 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FRMD3A2A2Y4 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FRMD3A2A2Y4 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FRMD3A2A2Y4 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FRMD3A2A2Y4 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FRMD3A2A2Y4 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FRMD3A2A2Y4 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FRMD3A2A2Y4 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms