Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms