Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms