Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNF0

PACSIN2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN2Q9UNF0 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PACSIN2Q9UNF0 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms