Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA8

RCAN3, Calcipressin-3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN3Q9UKA8 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RCAN3Q9UKA8 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RCAN3Q9UKA8 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RCAN3Q9UKA8 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RCAN3Q9UKA8 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RCAN3Q9UKA8 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RCAN3Q9UKA8 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RCAN3Q9UKA8 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RCAN3Q9UKA8 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RCAN3Q9UKA8 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RCAN3Q9UKA8 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RCAN3Q9UKA8 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RCAN3Q9UKA8 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RCAN3Q9UKA8 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RCAN3Q9UKA8 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RCAN3Q9UKA8 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RCAN3Q9UKA8 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RCAN3Q9UKA8 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RCAN3Q9UKA8 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RCAN3Q9UKA8 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RCAN3Q9UKA8 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RCAN3Q9UKA8 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RCAN3Q9UKA8 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RCAN3Q9UKA8 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RCAN3Q9UKA8 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RCAN3Q9UKA8 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RCAN3Q9UKA8 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RCAN3Q9UKA8 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RCAN3Q9UKA8 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RCAN3Q9UKA8 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RCAN3Q9UKA8 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RCAN3Q9UKA8 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RCAN3Q9UKA8 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RCAN3Q9UKA8 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RCAN3Q9UKA8 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RCAN3Q9UKA8 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RCAN3Q9UKA8 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RCAN3Q9UKA8 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RCAN3Q9UKA8 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RCAN3Q9UKA8 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RCAN3Q9UKA8 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RCAN3Q9UKA8 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RCAN3Q9UKA8 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RCAN3Q9UKA8 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RCAN3Q9UKA8 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RCAN3Q9UKA8 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RCAN3Q9UKA8 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RCAN3Q9UKA8 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RCAN3Q9UKA8 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RCAN3Q9UKA8 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RCAN3Q9UKA8 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RCAN3Q9UKA8 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RCAN3Q9UKA8 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RCAN3Q9UKA8 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RCAN3Q9UKA8 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RCAN3Q9UKA8 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RCAN3Q9UKA8 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RCAN3Q9UKA8 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RCAN3Q9UKA8 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RCAN3Q9UKA8 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RCAN3Q9UKA8 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RCAN3Q9UKA8 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RCAN3Q9UKA8 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RCAN3Q9UKA8 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RCAN3Q9UKA8 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RCAN3Q9UKA8 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RCAN3Q9UKA8 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RCAN3Q9UKA8 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RCAN3Q9UKA8 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms