Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TUBE1Q9UJT0 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms