Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHORDC1Q9UHD1 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHORDC1Q9UHD1 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHORDC1Q9UHD1 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHORDC1Q9UHD1 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHORDC1Q9UHD1 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHORDC1Q9UHD1 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHORDC1Q9UHD1 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHORDC1Q9UHD1 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHORDC1Q9UHD1 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHORDC1Q9UHD1 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHORDC1Q9UHD1 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHORDC1Q9UHD1 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHORDC1Q9UHD1 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHORDC1Q9UHD1 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHORDC1Q9UHD1 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHORDC1Q9UHD1 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHORDC1Q9UHD1 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHORDC1Q9UHD1 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHORDC1Q9UHD1 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHORDC1Q9UHD1 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHORDC1Q9UHD1 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHORDC1Q9UHD1 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHORDC1Q9UHD1 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHORDC1Q9UHD1 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHORDC1Q9UHD1 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHORDC1Q9UHD1 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHORDC1Q9UHD1 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHORDC1Q9UHD1 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHORDC1Q9UHD1 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHORDC1Q9UHD1 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHORDC1Q9UHD1 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CHORDC1Q9UHD1 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHORDC1Q9UHD1 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHORDC1Q9UHD1 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHORDC1Q9UHD1 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHORDC1Q9UHD1 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHORDC1Q9UHD1 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHORDC1Q9UHD1 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHORDC1Q9UHD1 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHORDC1Q9UHD1 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHORDC1Q9UHD1 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHORDC1Q9UHD1 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHORDC1Q9UHD1 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHORDC1Q9UHD1 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHORDC1Q9UHD1 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHORDC1Q9UHD1 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHORDC1Q9UHD1 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHORDC1Q9UHD1 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHORDC1Q9UHD1 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHORDC1Q9UHD1 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHORDC1Q9UHD1 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHORDC1Q9UHD1 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHORDC1Q9UHD1 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHORDC1Q9UHD1 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHORDC1Q9UHD1 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms