Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR5

CKLF, Chemokine-like factor, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKLFQ9UBR5 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CKLFQ9UBR5 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CKLFQ9UBR5 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CKLFQ9UBR5 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CKLFQ9UBR5 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CKLFQ9UBR5 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CKLFQ9UBR5 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CKLFQ9UBR5 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CKLFQ9UBR5 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CKLFQ9UBR5 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CKLFQ9UBR5 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CKLFQ9UBR5 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CKLFQ9UBR5 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CKLFQ9UBR5 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CKLFQ9UBR5 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CKLFQ9UBR5 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CKLFQ9UBR5 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CKLFQ9UBR5 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CKLFQ9UBR5 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CKLFQ9UBR5 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CKLFQ9UBR5 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CKLFQ9UBR5 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CKLFQ9UBR5 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CKLFQ9UBR5 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CKLFQ9UBR5 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CKLFQ9UBR5 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CKLFQ9UBR5 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CKLFQ9UBR5 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CKLFQ9UBR5 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CKLFQ9UBR5 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CKLFQ9UBR5 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CKLFQ9UBR5 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CKLFQ9UBR5 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CKLFQ9UBR5 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CKLFQ9UBR5 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CKLFQ9UBR5 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CKLFQ9UBR5 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CKLFQ9UBR5 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CKLFQ9UBR5 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CKLFQ9UBR5 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CKLFQ9UBR5 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CKLFQ9UBR5 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CKLFQ9UBR5 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CKLFQ9UBR5 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CKLFQ9UBR5 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CKLFQ9UBR5 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms