Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ6

EXTL2, Exostosin-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL2Q9UBQ6 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EXTL2Q9UBQ6 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EXTL2Q9UBQ6 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms