Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP35Q9P2H5 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP35Q9P2H5 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
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