Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms