Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXK8

FBXL12, F-box/LRR-repeat protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL12Q9NXK8 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FBXL12Q9NXK8 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms