Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX18

SDHAF2, Succinate dehydrogenase assembly factor 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF2Q9NX18 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SDHAF2Q9NX18 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms