Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMC4Q9NTJ3 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms