Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms