Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms