Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARFGAP3Q9NP61 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms