Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms