Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NRDE2Q9H7Z3 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NRDE2Q9H7Z3 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NRDE2Q9H7Z3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NRDE2Q9H7Z3 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NRDE2Q9H7Z3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NRDE2Q9H7Z3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NRDE2Q9H7Z3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NRDE2Q9H7Z3 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NRDE2Q9H7Z3 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NRDE2Q9H7Z3 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NRDE2Q9H7Z3 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NRDE2Q9H7Z3 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NRDE2Q9H7Z3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NRDE2Q9H7Z3 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NRDE2Q9H7Z3 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NRDE2Q9H7Z3 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NRDE2Q9H7Z3 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NRDE2Q9H7Z3 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NRDE2Q9H7Z3 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NRDE2Q9H7Z3 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NRDE2Q9H7Z3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NRDE2Q9H7Z3 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NRDE2Q9H7Z3 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NRDE2Q9H7Z3 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NRDE2Q9H7Z3 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NRDE2Q9H7Z3 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NRDE2Q9H7Z3 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NRDE2Q9H7Z3 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NRDE2Q9H7Z3 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
NRDE2Q9H7Z3 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NRDE2Q9H7Z3 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NRDE2Q9H7Z3 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NRDE2Q9H7Z3 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
NRDE2Q9H7Z3 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NRDE2Q9H7Z3 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NRDE2Q9H7Z3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NRDE2Q9H7Z3 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NRDE2Q9H7Z3 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NRDE2Q9H7Z3 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
NRDE2Q9H7Z3 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NRDE2Q9H7Z3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NRDE2Q9H7Z3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NRDE2Q9H7Z3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NRDE2Q9H7Z3 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NRDE2Q9H7Z3 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NRDE2Q9H7Z3 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NRDE2Q9H7Z3 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NRDE2Q9H7Z3 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NRDE2Q9H7Z3 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NRDE2Q9H7Z3 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NRDE2Q9H7Z3 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NRDE2Q9H7Z3 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NRDE2Q9H7Z3 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NRDE2Q9H7Z3 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NRDE2Q9H7Z3 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NRDE2Q9H7Z3 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NRDE2Q9H7Z3 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NRDE2Q9H7Z3 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NRDE2Q9H7Z3 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NRDE2Q9H7Z3 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NRDE2Q9H7Z3 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NRDE2Q9H7Z3 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NRDE2Q9H7Z3 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NRDE2Q9H7Z3 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NRDE2Q9H7Z3 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
NRDE2Q9H7Z3 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
NRDE2Q9H7Z3 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
NRDE2Q9H7Z3 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
NRDE2Q9H7Z3 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
NRDE2Q9H7Z3 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
NRDE2Q9H7Z3 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
NRDE2Q9H7Z3 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NRDE2Q9H7Z3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NRDE2Q9H7Z3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NRDE2Q9H7Z3 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NRDE2Q9H7Z3 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NRDE2Q9H7Z3 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NRDE2Q9H7Z3 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
NRDE2Q9H7Z3 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
NRDE2Q9H7Z3 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NRDE2Q9H7Z3 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NRDE2Q9H7Z3 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NRDE2Q9H7Z3 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NRDE2Q9H7Z3 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NRDE2Q9H7Z3 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NRDE2Q9H7Z3 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NRDE2Q9H7Z3 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NRDE2Q9H7Z3 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NRDE2Q9H7Z3 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NRDE2Q9H7Z3 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NRDE2Q9H7Z3 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NRDE2Q9H7Z3 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NRDE2Q9H7Z3 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NRDE2Q9H7Z3 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NRDE2Q9H7Z3 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NRDE2Q9H7Z3 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NRDE2Q9H7Z3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NRDE2Q9H7Z3 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NRDE2Q9H7Z3 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms