Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ7

GFRA4, GDNF family receptor alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA4Q9GZZ7 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
GFRA4Q9GZZ7 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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