Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms