Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E8

LNPK, Protein lunapark, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPKQ9C0E8 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms