Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM55Q9BYV6 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms