Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY43

CHMP4A, Charged multivesicular body protein 4a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4AQ9BY43 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms