Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRIP1Q9BX63 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRIP1Q9BX63 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms