Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG9

PTDSS2, Phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2Q9BVG9 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTDSS2Q9BVG9 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
PTDSS2Q9BVG9 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTDSS2Q9BVG9 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTDSS2Q9BVG9 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
PTDSS2Q9BVG9 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTDSS2Q9BVG9 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTDSS2Q9BVG9 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTDSS2Q9BVG9 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTDSS2Q9BVG9 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTDSS2Q9BVG9 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTDSS2Q9BVG9 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTDSS2Q9BVG9 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTDSS2Q9BVG9 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTDSS2Q9BVG9 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTDSS2Q9BVG9 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTDSS2Q9BVG9 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTDSS2Q9BVG9 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTDSS2Q9BVG9 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTDSS2Q9BVG9 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PTDSS2Q9BVG9 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTDSS2Q9BVG9 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PTDSS2Q9BVG9 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PTDSS2Q9BVG9 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTDSS2Q9BVG9 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTDSS2Q9BVG9 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTDSS2Q9BVG9 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTDSS2Q9BVG9 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTDSS2Q9BVG9 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PTDSS2Q9BVG9 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTDSS2Q9BVG9 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTDSS2Q9BVG9 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTDSS2Q9BVG9 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTDSS2Q9BVG9 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTDSS2Q9BVG9 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTDSS2Q9BVG9 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTDSS2Q9BVG9 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTDSS2Q9BVG9 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTDSS2Q9BVG9 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTDSS2Q9BVG9 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTDSS2Q9BVG9 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTDSS2Q9BVG9 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTDSS2Q9BVG9 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTDSS2Q9BVG9 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTDSS2Q9BVG9 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTDSS2Q9BVG9 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTDSS2Q9BVG9 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTDSS2Q9BVG9 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTDSS2Q9BVG9 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTDSS2Q9BVG9 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTDSS2Q9BVG9 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTDSS2Q9BVG9 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTDSS2Q9BVG9 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTDSS2Q9BVG9 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTDSS2Q9BVG9 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTDSS2Q9BVG9 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTDSS2Q9BVG9 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTDSS2Q9BVG9 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTDSS2Q9BVG9 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTDSS2Q9BVG9 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTDSS2Q9BVG9 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTDSS2Q9BVG9 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTDSS2Q9BVG9 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTDSS2Q9BVG9 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTDSS2Q9BVG9 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTDSS2Q9BVG9 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTDSS2Q9BVG9 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTDSS2Q9BVG9 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTDSS2Q9BVG9 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTDSS2Q9BVG9 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTDSS2Q9BVG9 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTDSS2Q9BVG9 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTDSS2Q9BVG9 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTDSS2Q9BVG9 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms