Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms