Protein–RNA interactions for Protein: Q99795

GPA33, Cell surface A33 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPA33Q99795 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPA33Q99795 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPA33Q99795 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPA33Q99795 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPA33Q99795 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPA33Q99795 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPA33Q99795 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPA33Q99795 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPA33Q99795 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPA33Q99795 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPA33Q99795 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPA33Q99795 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GPA33Q99795 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPA33Q99795 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPA33Q99795 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPA33Q99795 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPA33Q99795 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPA33Q99795 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPA33Q99795 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPA33Q99795 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPA33Q99795 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPA33Q99795 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPA33Q99795 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPA33Q99795 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPA33Q99795 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GPA33Q99795 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GPA33Q99795 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GPA33Q99795 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GPA33Q99795 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GPA33Q99795 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GPA33Q99795 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GPA33Q99795 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GPA33Q99795 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GPA33Q99795 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GPA33Q99795 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms