Protein–RNA interactions for Protein: Q99590

SCAF11, Protein SCAF11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF11Q99590 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SCAF11Q99590 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCAF11Q99590 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SCAF11Q99590 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCAF11Q99590 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SCAF11Q99590 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCAF11Q99590 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCAF11Q99590 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCAF11Q99590 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCAF11Q99590 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCAF11Q99590 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCAF11Q99590 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCAF11Q99590 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCAF11Q99590 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCAF11Q99590 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCAF11Q99590 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCAF11Q99590 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCAF11Q99590 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCAF11Q99590 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCAF11Q99590 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCAF11Q99590 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCAF11Q99590 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCAF11Q99590 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCAF11Q99590 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCAF11Q99590 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCAF11Q99590 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCAF11Q99590 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCAF11Q99590 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCAF11Q99590 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCAF11Q99590 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCAF11Q99590 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCAF11Q99590 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCAF11Q99590 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCAF11Q99590 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCAF11Q99590 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCAF11Q99590 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCAF11Q99590 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SCAF11Q99590 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCAF11Q99590 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCAF11Q99590 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SCAF11Q99590 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCAF11Q99590 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCAF11Q99590 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SCAF11Q99590 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCAF11Q99590 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms