Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms