Protein–RNA interactions for Protein: Q96LY2

CCDC74B, Coiled-coil domain-containing protein 74B, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74BQ96LY2 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC74BQ96LY2 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms