Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 C21orf62-AS1-201ENST00000382375 2453 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -1
PRAC1Q96KF2 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -1
PRAC1Q96KF2 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -1
PRAC1Q96KF2 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -1
PRAC1Q96KF2 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC8.84□□□□□ -1
PRAC1Q96KF2 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
PRAC1Q96KF2 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
PRAC1Q96KF2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
PRAC1Q96KF2 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
PRAC1Q96KF2 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
PRAC1Q96KF2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC8.83□□□□□ -1
PRAC1Q96KF2 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
PRAC1Q96KF2 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
PRAC1Q96KF2 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
PRAC1Q96KF2 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
PRAC1Q96KF2 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
PRAC1Q96KF2 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
PRAC1Q96KF2 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
PRAC1Q96KF2 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms