Protein–RNA interactions for Protein: Q96JK4

HHIPL1, HHIP-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPL1Q96JK4 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HHIPL1Q96JK4 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
HHIPL1Q96JK4 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HHIPL1Q96JK4 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HHIPL1Q96JK4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HHIPL1Q96JK4 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HHIPL1Q96JK4 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HHIPL1Q96JK4 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HHIPL1Q96JK4 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HHIPL1Q96JK4 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HHIPL1Q96JK4 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HHIPL1Q96JK4 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HHIPL1Q96JK4 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
HHIPL1Q96JK4 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HHIPL1Q96JK4 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
HHIPL1Q96JK4 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HHIPL1Q96JK4 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HHIPL1Q96JK4 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HHIPL1Q96JK4 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HHIPL1Q96JK4 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HHIPL1Q96JK4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HHIPL1Q96JK4 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HHIPL1Q96JK4 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HHIPL1Q96JK4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HHIPL1Q96JK4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HHIPL1Q96JK4 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
HHIPL1Q96JK4 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
HHIPL1Q96JK4 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HHIPL1Q96JK4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HHIPL1Q96JK4 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HHIPL1Q96JK4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HHIPL1Q96JK4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HHIPL1Q96JK4 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HHIPL1Q96JK4 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HHIPL1Q96JK4 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HHIPL1Q96JK4 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
HHIPL1Q96JK4 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HHIPL1Q96JK4 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
HHIPL1Q96JK4 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HHIPL1Q96JK4 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HHIPL1Q96JK4 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HHIPL1Q96JK4 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HHIPL1Q96JK4 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HHIPL1Q96JK4 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
HHIPL1Q96JK4 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HHIPL1Q96JK4 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
HHIPL1Q96JK4 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HHIPL1Q96JK4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HHIPL1Q96JK4 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HHIPL1Q96JK4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HHIPL1Q96JK4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HHIPL1Q96JK4 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HHIPL1Q96JK4 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HHIPL1Q96JK4 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HHIPL1Q96JK4 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HHIPL1Q96JK4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HHIPL1Q96JK4 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HHIPL1Q96JK4 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HHIPL1Q96JK4 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HHIPL1Q96JK4 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HHIPL1Q96JK4 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HHIPL1Q96JK4 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HHIPL1Q96JK4 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HHIPL1Q96JK4 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HHIPL1Q96JK4 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HHIPL1Q96JK4 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HHIPL1Q96JK4 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HHIPL1Q96JK4 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
HHIPL1Q96JK4 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HHIPL1Q96JK4 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HHIPL1Q96JK4 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
HHIPL1Q96JK4 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HHIPL1Q96JK4 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HHIPL1Q96JK4 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
HHIPL1Q96JK4 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
HHIPL1Q96JK4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HHIPL1Q96JK4 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HHIPL1Q96JK4 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HHIPL1Q96JK4 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HHIPL1Q96JK4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HHIPL1Q96JK4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HHIPL1Q96JK4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HHIPL1Q96JK4 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HHIPL1Q96JK4 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
HHIPL1Q96JK4 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HHIPL1Q96JK4 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HHIPL1Q96JK4 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HHIPL1Q96JK4 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HHIPL1Q96JK4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HHIPL1Q96JK4 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HHIPL1Q96JK4 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HHIPL1Q96JK4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HHIPL1Q96JK4 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HHIPL1Q96JK4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HHIPL1Q96JK4 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HHIPL1Q96JK4 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HHIPL1Q96JK4 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HHIPL1Q96JK4 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HHIPL1Q96JK4 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HHIPL1Q96JK4 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms