Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TPD52L3Q96J77 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms