Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ9

CMTM5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM5Q96DZ9 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CMTM5Q96DZ9 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms