Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms