Protein–RNA interactions for Protein: Q969K7

TMEM54, Transmembrane protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM54Q969K7 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms