Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUW1

BRK1, Protein BRICK1, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRK1Q8WUW1 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 ST6GAL2-201ENST00000361686 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 KIAA0513-201ENST00000258180 7404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 TBX3-201ENST00000257566 4208 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 HCFC1-202ENST00000369984 8375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 MYO9B-206ENST00000595618 7623 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 NQO2-205ENST00000380455 10084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms