Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms