Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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