Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms