Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC06

ACBD4, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACBD4Q8NC06 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms