Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Q1

FAM71E2, Protein FAM71E2, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71E2Q8N5Q1 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM71E2Q8N5Q1 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM71E2Q8N5Q1 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM71E2Q8N5Q1 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM71E2Q8N5Q1 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM71E2Q8N5Q1 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM71E2Q8N5Q1 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM71E2Q8N5Q1 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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FAM71E2Q8N5Q1 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM71E2Q8N5Q1 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM71E2Q8N5Q1 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM71E2Q8N5Q1 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM71E2Q8N5Q1 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM71E2Q8N5Q1 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM71E2Q8N5Q1 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM71E2Q8N5Q1 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM71E2Q8N5Q1 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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FAM71E2Q8N5Q1 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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FAM71E2Q8N5Q1 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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FAM71E2Q8N5Q1 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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FAM71E2Q8N5Q1 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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FAM71E2Q8N5Q1 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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FAM71E2Q8N5Q1 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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FAM71E2Q8N5Q1 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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FAM71E2Q8N5Q1 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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FAM71E2Q8N5Q1 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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