Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHCHD4Q8N4Q1 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHCHD4Q8N4Q1 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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