Protein–RNA interactions for Protein: Q8N300

SVBP, Small vasohibin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVBPQ8N300 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SVBPQ8N300 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SVBPQ8N300 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SVBPQ8N300 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SVBPQ8N300 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SVBPQ8N300 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SVBPQ8N300 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SVBPQ8N300 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SVBPQ8N300 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SVBPQ8N300 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SVBPQ8N300 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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