Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms