Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HECW1Q76N89 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms