Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
BBS12Q6ZW61 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BBS12Q6ZW61 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms