Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQX7

LIAT1, Protein LIAT1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIAT1Q6ZQX7 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 LINC01670-203ENST00000624859 977 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms