Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms